Luc Bondy est né à Zurich et a passé son enfance en France.
Après avoir fréquenté l'école de pantomime de Jacques Lecoq, il fait ses débuts au Théâtre Universitaire International de Paris.

En 1969, il devient assistant au Thalia Theater de Hambourg et, dès 1971, met en scène Les Bonnes de Jean Genet, La Nuit des rois de Shakespeare ou La Mer de Edward Bond.

De 1974 à 1976, il travaille à la Städtische Bühne de Francfort. Par la suite, il réalise de nombreuses mises en scène pour la Schaubühne de Berlin dirigée alors par Peter Stein.

Puis, de 1985 à 1987, il est co-directeur de cette même scène. Parmi ses mises en scène importantes, il convient de citer Das weite Land d'Arthur Schnitzler (Nanterre, 1984), Le Conte d'hiver de Shakespeare (Nanterre et Avignon, 1988, Berlin 1990), Le Temps et la chambre de Botho Strauss (Berlin 1989), John Gabriel Borkman de Henrik Ibsen (Lausanne, Paris et Vienne, 1993), Phèdre de Racine (Lausanne, Paris et Vienne, 1998), En attendant Godot de Samuel Beckett (Lausanne et Vienne, 1999), La Mouette d'Anton Tchekhov (Vienne, 2000), et La Campagne de Martin Crimp (Vienne et Paris, 2002).
Il réalise de nombreuses mises en scène d'opéra, à commencer par Wozzeck en 1976 à Hambourg, puis, entre autres, Così fan tutte (Bruxelles, 1986), Salomé (Salzbourg, Florence, Londres et Paris, dès 1992), Don Carlos (Paris, 1996) et, dernièrement, Macbeth à Edimbourg et Vienne ainsi que le Conte d'hiver de Boesmans à Bruxelles, Lyon et Paris.

Depuis 1997, il enseigne au Max-Reinhardt-Seminar. Il a publié plusieurs livres, vient de réaliser pour le cinéma Ne Fais pas ça (sortie 2004) et dirige actuellement le Festival de Vienne.

Luc Bondy a mis en scène Trois versions de la vie de Yasmina Reza à Vienne en 2000.